Arrêt maladie dérogatoire vers chômage partiel

Bonjour 

Je suis une personne à risque vulnérable avec ALD reconnue par la CPAM j ai arrêté mon travail le 16 mars , j ai reçu le volet 3 que j ai transmis à l employeur et je lui ai également transmis dans un deuxième temps le feuillet indiquant ma prolongation automatique jusqu au 30 avril ! Il m à envoyé un message disant qu il me plaçait en chômage partiel ! Aujourd hui il me demande une prolongation d arrêt maladie du 1 er mai à ce jour , et indique que j aurais du lui transmettre cette prolongation dans les temps ! Suggérant peut être une faute de ma part ! Que dois je faire ?