Congé maternité : maintien avec subrogation & IJSS

Bonjour,

Je débute en paie et j'ai une question sur un de mes bulletins.

Une salariée est en congé maternité depuis janvier. Son salaire a été maintenu à 100% avec subrogation.

L'employeur a donc perçu les IJSS mais jusqu'à présent rien a été passé sur le bulletin de salaire.

Ce mois ci la salariée est en congé parental et l'employeur m'a transmis tous les relevés d'ijss.

Je veux donc les déduire de ma base de cotisation car les IJSS ne sont pas soumises à cotisations.

En revanche, dans pas mal d'exemple je constate qu'il faut payer en net les IJSS nettes. Je ne comprends pas pourquoi car pour moi la salariée a tout le temps de sa maternité perçu son salaire net habituel, pourquoi rajouter une rubrique d'ijss nettes à lui payer en bas de bulletin ?

D'avance merci pour vos réponses.